MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 3987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000854	TAA	2	6	401532	401537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_000854	ATG	2	6	401552	401557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_000854	CCT	2	6	401590	401595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_000854	TGC	2	6	401633	401638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_000854	TAG	2	6	401894	401899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_000854	GAA	2	6	401925	401930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_000854	AGA	2	6	401969	401974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_000854	CTCC	2	8	402038	402045	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1009	NC_000854	GTA	2	6	402053	402058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_000854	CGCC	2	8	402168	402175	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1011	NC_000854	TTA	2	6	402238	402243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_000854	ATG	2	6	402265	402270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_000854	CT	3	6	402316	402321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_000854	GGT	2	6	402331	402336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_000854	TGAT	2	8	402345	402352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_000854	TAG	2	6	402359	402364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_000854	GGGGA	2	10	402393	402402	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_000854	ACC	2	6	402415	402420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_000854	CCCT	2	8	402464	402471	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1020	NC_000854	TGG	2	6	402990	402995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_000854	G	6	6	403000	403005	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_000854	CCG	2	6	403073	403078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_000854	GCCC	2	8	403100	403107	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1024	NC_000854	TTGT	2	8	403119	403126	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_000854	TCA	2	6	403207	403212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_000854	GCC	2	6	403215	403220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1028	NC_000854	CT	3	6	403263	403268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_000854	TGGT	2	8	404380	404387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_000854	GTT	2	6	404397	404402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_000854	GCC	2	6	404414	404419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_000854	C	6	6	405878	405883	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1033	NC_000854	TAT	2	6	405903	405908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_000854	G	6	6	406967	406972	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_000854	TCC	2	6	406980	406985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_000854	CCA	2	6	406987	406992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_000854	CAG	2	6	407024	407029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_000854	TACA	2	8	407099	407106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_000854	CTC	2	6	407148	407153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_000854	CCT	2	6	407207	407212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_000854	CCG	2	6	407232	407237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_000854	C	6	6	407266	407271	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1043	NC_000854	A	6	6	407350	407355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_000854	GCC	2	6	407380	407385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_000854	ACCC	2	8	411392	411399	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1046	NC_000854	TAG	2	6	411405	411410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_000854	GGA	2	6	411434	411439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_000854	TAAAG	2	10	411545	411554	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_000854	TTTAA	2	10	411583	411592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_000854	GCC	2	6	411613	411618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_000854	C	6	6	416347	416352	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1052	NC_000854	C	6	6	416365	416370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1053	NC_000854	CCT	2	6	416398	416403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_000854	ACGG	2	8	416422	416429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_000854	G	6	6	416501	416506	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_000854	AGT	2	6	416511	416516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_000854	G	6	6	416536	416541	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_000854	GGA	2	6	416557	416562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_000854	CCA	2	6	418216	418221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_000854	G	6	6	418253	418258	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_000854	GT	3	6	418267	418272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_000854	GGCG	2	8	419580	419587	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_000854	G	7	7	425510	425516	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_000854	AGTG	2	8	425538	425545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_000854	GTG	2	6	425549	425554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_000854	AGTGT	2	10	425583	425592	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_000854	C	6	6	427090	427095	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1068	NC_000854	ATT	2	6	427133	427138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_000854	GGA	2	6	428467	428472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_000854	CCG	2	6	428535	428540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_000854	GGT	2	6	428577	428582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_000854	C	6	6	428596	428601	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1073	NC_000854	CAC	2	6	428607	428612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_000854	GAG	2	6	428664	428669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_000854	GAGG	2	8	428706	428713	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1077	NC_000854	GGCT	2	8	428752	428759	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_000854	CCG	2	6	428804	428809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_000854	TGG	2	6	428873	428878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_000854	GTG	2	6	428897	428902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_000854	GCAA	2	8	429225	429232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_000854	T	6	6	429237	429242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_000854	CGT	2	6	429264	429269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1086	NC_000854	G	6	6	431209	431214	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_000854	ATA	2	6	431238	431243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_000854	GA	3	6	431250	431255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_000854	GCC	2	6	431317	431322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_000854	GTA	2	6	431358	431363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_000854	AGC	2	6	431410	431415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_000854	GT	3	6	432225	432230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_000854	C	6	6	432247	432252	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1094	NC_000854	GGCG	2	8	432253	432260	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_000854	G	6	6	432263	432268	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_000854	GCCC	2	8	432726	432733	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1097	NC_000854	TGC	2	6	432756	432761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1099	NC_000854	CCT	2	6	434742	434747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_000854	GAG	2	6	434807	434812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_000854	GCT	2	6	434819	434824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_000854	CA	3	6	438855	438860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_000854	CTCC	2	8	439140	439147	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1104	NC_000854	ATA	2	6	439187	439192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_000854	TGA	2	6	439199	439204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_000854	ATG	2	6	439275	439280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_000854	G	6	6	439285	439290	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_000854	AGG	2	6	441757	441762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_000854	C	7	7	441771	441777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1110	NC_000854	CCACG	2	10	444957	444966	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1111	NC_000854	C	6	6	444992	444997	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1112	NC_000854	CTC	2	6	445027	445032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_000854	GAA	2	6	445048	445053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_000854	AAAC	2	8	445101	445108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_000854	AC	3	6	445113	445118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_000854	GT	3	6	445180	445185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_000854	G	6	6	445226	445231	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_000854	AAC	2	6	445234	445239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_000854	CCACCC	2	12	445255	445266	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
1120	NC_000854	GAG	2	6	445275	445280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_000854	GGC	2	6	445320	445325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_000854	CGG	2	6	445353	445358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_000854	C	6	6	445377	445382	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1124	NC_000854	CG	3	6	445389	445394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_000854	CCG	2	6	445420	445425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_000854	GGC	2	6	445428	445433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_000854	TGC	2	6	445468	445473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_000854	GGC	2	6	445488	445493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_000854	GGGC	2	8	446788	446795	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_000854	C	6	6	446837	446842	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1131	NC_000854	CAC	2	6	446844	446849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_000854	TACA	2	8	448760	448767	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_000854	TCC	2	6	448791	448796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_000854	CGG	2	6	448800	448805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_000854	G	6	6	448878	448883	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_000854	ATG	2	6	448885	448890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_000854	CCA	2	6	449879	449884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1411	NC_000854	GTT	2	6	552736	552741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_000854	CTC	2	6	552767	552772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1413	NC_000854	GTG	2	6	554218	554223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_000854	CCT	2	6	555503	555508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1415	NC_000854	G	7	7	555512	555518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_000854	G	6	6	558625	558630	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1418	NC_000854	AT	3	6	559653	559658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_000854	GTG	2	6	559662	559667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_000854	ACC	2	6	559949	559954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1421	NC_000854	TGG	2	6	562434	562439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_000854	CCA	2	6	564055	564060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1423	NC_000854	G	6	6	564152	564157	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_000854	GTT	2	6	564234	564239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_000854	TAA	2	6	564265	564270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_000854	CTG	2	6	564271	564276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1429	NC_000854	GGC	2	6	565898	565903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1432	NC_000854	GGC	3	9	568396	568404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1435	NC_000854	AC	3	6	568477	568482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1436	NC_000854	C	6	6	568493	568498	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1437	NC_000854	CA	4	8	568501	568508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1438	NC_000854	G	6	6	568528	568533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1441	NC_000854	AAT	2	6	570416	570421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_000854	GATAA	2	10	570538	570547	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_000854	CTTT	2	8	570665	570672	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1444	NC_000854	GGC	2	6	570701	570706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1446	NC_000854	TGG	2	6	570832	570837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_000854	GCC	2	6	573521	573526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1448	NC_000854	CTTC	2	8	577858	577865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1449	NC_000854	CTA	2	6	578204	578209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_000854	TTA	2	6	578278	578283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_000854	GGT	2	6	580024	580029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_000854	CA	3	6	580644	580649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1454	NC_000854	CGG	2	6	580695	580700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1455	NC_000854	CCA	2	6	580728	580733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1456	NC_000854	TGTCT	2	10	580760	580769	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1457	NC_000854	TGT	2	6	580774	580779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_000854	GCA	2	6	580786	580791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1462	NC_000854	CCT	2	6	581023	581028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1465	NC_000854	TG	3	6	581563	581568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1466	NC_000854	CT	3	6	581619	581624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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